Pengajar Pondok Pesantren Tahfidzil Qur’an Muhammadiyah Ibnu Juraimi Yogyakarta terdiri dari lulusan luar negeri ( Universitas Islam Madinah, Al Azhar University Cairo Mesir, dll) maupun lulusan dalam negeri ( LIPIA Jakarta, UNIDA Gontor, PUTM, dll) yang sudah berpengalaman dan berkompeten dibidangnya, antara lain :
- Ustadz H. Charis Thohari Rohman, S.Sy, S.Th.I, Al-Hafidz
– Mudir Pondok Pesantren Tahfidzil Qur’an Muhammadiyah Ibnu Juraimi Yogyakarta
– Sanad dari Syaikh Mudawi Ma’arif; Salah Satu Syaikhul Qurro’ Dunia dan Pemegang Sanad Muttashil Qira’ah Asyarah sampai Rasulullah SAW.
– Sanad Al Jazary, 13 generasi antara beliau dengan Ibnu Al Jazary.
- Ustadz Muzayyin Luthfie, Lc
- Ustadz Azhar Alimudin, Lc
- Ustadz Anton Ismunanto, S.Pd.I., M.Si.
- Ustadz H. Taufiq Rahman, Lc., M.Si.
- Ustadz H. Mujibullah, S.Pd.I., Lc., Al Hafidz
- Ustadz Setyawan Tugiono, Lc
- Ustadz Alfitra Angga
- Ustadz Muhammad Farhan Al Hijri, Al Hafidz
- Ustadz Andi Muhammad Nur Qadri, Al Hafidz